Származási helye Tirol. A terület őshonos, kistermetű lovai képezték a fajta alapját, amelyek a tiroli paraszt hegyi málhás lovaként végezték mindennapi munkájukat. Tudatos tenyésztése az 1800-as évek utolsó negyedében indult el, az 1874-ben Dél-Tirolban született 249 Folie nevű mén felvásárlásával és felállításával. E ménnek még két fia, az 1887-ben született 14 Folie és az 1897-es születésű 252/233 Hafling játszott szerepet a fajtává válásban. A 249 Folie előtt, szerepet kapott még az 1868-as születésű 133 El Bedavi XII arabfélvér ló is (El Bedavik Bábolnán is fedeztek.)
A 249 Folie felállítása után, a fajtatiszta tenyésztés vált elsődlegessé és kizárólagossá a fajta tenyésztésében.
Ezzel lezárult a fajta kialakulásának első szakasza.
1897-1904. között jelölik meg a fajta fejlődésének második korszakát. Ebben az időben alakulnak meg az első tenyésztőtársaságok Huyn gróf fáradozásának eredményeként.
Ő, a tenyésztési szabályzatok kidolgozásával és betartatásával konszolidálta a tenyésztést. 1904-ben, Möltenben, megalakult az első Haflingi Lótenyésztő Társaság.
Az 1912-1923. közötti harmadik szakasz meghatározó erejű a fajta fejlődésére és későbbi elterjedtségére. A St. Germain-i békeszerződéssel, 1919-ben, kettévált Észak- és Dél-Tirol. Észak-Tirol továbbra is osztrák terület maradt, míg Dél-Tirol Olaszországhoz került. A szétválás idején, a haflingi állomány jelentősebb része osztrák területen volt. A szigorú tenyésztési fegyelem, és az egyértelmű tenyészcél érdekében végzett szelekció gyors tenyésztési előrehaladást eredményezett.
Már 1920-ban megindult az első tenyésztőtársaság szervezése, és az 1921-ben Zams-ban meg is alakult. 1920-ban megszervezték az első tenyészszemlét és kiállítást.
A fajta fejlődésének és kialakulásának negyedik szakasza az 1924-1947. közötti időszakra tehető.
Dr. Thurner nagy érdeme, hogy 1926-ban megjelenhetett az első haflingi kancatörzskönyv, amelyet 1938-ban kiegészített a mének genealógiai vonalával.
A fajta vonalalapító ménjei: Bolzano (született: 1915), Nibbio (1920), Willi (1921), Stelvio (1923), Anselmo (1926), Massimo (1927), Student (1927).
A fajta fejlődésének ötödik szakaszában – 1947-1961. között – kiépítették a minőségi kancacsaládokat, megvalósították a következetes fajtatiszta tenyésztést, és ezekre az eredményekre támaszkodva kiléptek a nemzetközi porondra.
A fajta legújabb kori történetét 1976-tól számíthatjuk. Ekkor alakult meg a Haflingi Lovat Tenyésztők Világszövetsége.
A jelenlegi helyzethez tartozik, hogy 2013. február 1. nappal a haflingi fajta tevékenységi körében kibővített világszervezetét Haflinger Welt- Zucht- und Sportvereinigung (HWZSV) néven megalakították. Létrejött az Europäischen Verbandes der Haflinger Pferdezüchter (EVH) Haflingi Tenyésztők Európai Szövetsége is.
A fajta a világ minden országában rendkívül népszerű. Népszerűségét a kitűnő menedzsmenten túl a fajta univerzális jellegének és sajátságos színének köszönheti. Magyarországon is igen sok híve akadt.